Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SnrpcQ62241 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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