Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sin3bQ62141 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms