Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf8Q60846 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf8Q60846 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms