Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samhd1Q60710 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samhd1Q60710 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samhd1Q60710 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms