Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms