Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERC4Q5GLZ8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC4Q5GLZ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms