Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5EBG8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5EBG8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms