Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb3Q571F5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms