Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc160Q3UYG1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc160Q3UYG1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms