Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms