Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mier3Q3UHF3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mier3Q3UHF3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mier3Q3UHF3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mier3Q3UHF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mier3Q3UHF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms