Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem248Q3TBN1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms