Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDK1Q15118 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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