Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFSWAPQ12872 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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