Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3C1Q12789 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C1Q12789 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms