Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox4Q06831 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox4Q06831 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms