Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FMODQ06828 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FMODQ06828 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FMODQ06828 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FMODQ06828 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FMODQ06828 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FMODQ06828 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FMODQ06828 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms