Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga4Q00651 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga4Q00651 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms