Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfdP97946 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VegfdP97946 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms