Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms