Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd1P97443 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd1P97443 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd1P97443 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms