Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cbx1P83917 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms