Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASIC1P78348 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC1P78348 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms