Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NficP70255 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NficP70255 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NficP70255 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NficP70255 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NficP70255 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NficP70255 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NficP70255 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NficP70255 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NficP70255 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NficP70255 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NficP70255 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NficP70255 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NficP70255 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NficP70255 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NficP70255 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NficP70255 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NficP70255 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NficP70255 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NficP70255 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NficP70255 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NficP70255 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NficP70255 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NficP70255 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NficP70255 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NficP70255 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NficP70255 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NficP70255 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms