Protein–RNA interactions for Protein: P61922

Abat, 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbatP61922 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AbatP61922 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AbatP61922 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AbatP61922 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AbatP61922 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AbatP61922 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AbatP61922 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AbatP61922 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AbatP61922 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AbatP61922 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AbatP61922 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AbatP61922 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AbatP61922 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AbatP61922 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AbatP61922 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AbatP61922 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AbatP61922 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AbatP61922 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AbatP61922 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AbatP61922 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AbatP61922 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AbatP61922 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AbatP61922 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AbatP61922 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AbatP61922 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AbatP61922 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AbatP61922 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AbatP61922 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AbatP61922 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AbatP61922 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AbatP61922 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AbatP61922 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AbatP61922 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AbatP61922 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AbatP61922 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AbatP61922 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AbatP61922 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AbatP61922 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AbatP61922 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AbatP61922 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AbatP61922 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms