Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms