Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr4P51680 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccr4P51680 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms