Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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PtpreP49446 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpreP49446 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtpreP49446 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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