Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms