Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11bP46638 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms