Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sdc2P43407 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc2P43407 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms