Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sept1P42209 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept1P42209 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sept1P42209 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept1P42209 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms