Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms