Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl12P35979 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms