Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms