Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPP30301 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPP30301 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPP30301 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPP30301 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPP30301 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPP30301 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPP30301 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIPP30301 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIPP30301 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIPP30301 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIPP30301 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIPP30301 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPP30301 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPP30301 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPP30301 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPP30301 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPP30301 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPP30301 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPP30301 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPP30301 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPP30301 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPP30301 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPP30301 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPP30301 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPP30301 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPP30301 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MIPP30301 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPP30301 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPP30301 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPP30301 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPP30301 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPP30301 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms