Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LoxP28301 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LoxP28301 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LoxP28301 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LoxP28301 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LoxP28301 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LoxP28301 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LoxP28301 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LoxP28301 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LoxP28301 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LoxP28301 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LoxP28301 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LoxP28301 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LoxP28301 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LoxP28301 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LoxP28301 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LoxP28301 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LoxP28301 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LoxP28301 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LoxP28301 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LoxP28301 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LoxP28301 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LoxP28301 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms