Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou3f1P21952 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pou3f1P21952 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou3f1P21952 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms