Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrm1P12657 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrm1P12657 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrm1P12657 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrm1P12657 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrm1P12657 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrm1P12657 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chrm1P12657 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Chrm1P12657 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Chrm1P12657 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chrm1P12657 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chrm1P12657 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chrm1P12657 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chrm1P12657 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Chrm1P12657 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chrm1P12657 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chrm1P12657 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chrm1P12657 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms