Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Jmjd7P0C872 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Jmjd7P0C872 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Jmjd7P0C872 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms