Protein–RNA interactions for Protein: P07607

Tyms, Thymidylate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TymsP07607 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TymsP07607 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TymsP07607 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TymsP07607 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TymsP07607 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TymsP07607 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TymsP07607 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TymsP07607 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TymsP07607 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TymsP07607 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TymsP07607 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TymsP07607 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TymsP07607 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TymsP07607 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TymsP07607 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TymsP07607 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TymsP07607 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TymsP07607 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TymsP07607 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TymsP07607 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TymsP07607 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TymsP07607 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259 ms