Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06335 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06335 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06335 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06335 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06335 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06335 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P06335 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06335 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06335 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06335 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06335 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06335 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06335 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06335 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06335 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P06335 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms