Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB6O95452 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB6O95452 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB6O95452 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB6O95452 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB6O95452 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB6O95452 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB6O95452 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB6O95452 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB6O95452 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB6O95452 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB6O95452 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB6O95452 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB6O95452 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB6O95452 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms