Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP2O75323 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms