Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CaskO70589 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CaskO70589 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CaskO70589 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CaskO70589 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CaskO70589 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CaskO70589 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CaskO70589 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CaskO70589 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CaskO70589 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CaskO70589 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CaskO70589 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CaskO70589 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CaskO70589 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms