Protein–RNA interactions for Protein: O54926

Siva1, Apoptosis regulatory protein Siva, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siva1O54926 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siva1O54926 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms