Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA2O43464 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms