Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab33bO35963 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms