Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ArxO35085 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArxO35085 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArxO35085 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArxO35085 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArxO35085 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ArxO35085 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ArxO35085 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArxO35085 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArxO35085 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArxO35085 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArxO35085 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ArxO35085 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ArxO35085 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArxO35085 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArxO35085 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArxO35085 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ArxO35085 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArxO35085 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArxO35085 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArxO35085 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArxO35085 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ArxO35085 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArxO35085 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArxO35085 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArxO35085 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArxO35085 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArxO35085 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArxO35085 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ArxO35085 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArxO35085 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArxO35085 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArxO35085 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ArxO35085 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArxO35085 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArxO35085 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArxO35085 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArxO35085 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ArxO35085 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArxO35085 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArxO35085 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArxO35085 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArxO35085 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArxO35085 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArxO35085 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArxO35085 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArxO35085 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ArxO35085 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ArxO35085 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ArxO35085 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ArxO35085 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ArxO35085 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArxO35085 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArxO35085 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms