Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRTO14522 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRTO14522 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRTO14522 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
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